El objetivo del Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos es generar información de calidad de orden nacional, coordinando y siendo referencia de la RNLSP, en materia de diagnóstico, investigación, capacitación y desarrollo tecnológico, para la vigilancia epidemiológica que permita la toma de decisiones en el control de enfermedades y la formulación y orientación de los programas nacionales de salud.

Dentro de su normativa se conforma por los siguientes puntos: